Capítulo 6 Apareamientos no-aleatorios
Ejercicio 6.1
Consideremos un ensemble de 3 poblaciones de una especie diploide, cada una con 12 individuos. En un locus analizado, con dos alelos, se encontraron las siguiente frecuencias de genotipos:
| Genotipo | Población 1 | Población 2 | Población 3 |
|---|---|---|---|
| \(A_1A_1\) | \(4\) | \(5\) | \(3\) |
| \(A_1A_2\) | \(5\) | \(2\) | \(1\) |
| \(A_2A_2\) | \(3\) | \(5\) | \(8\) |
| TOTAL | \(12\) | \(12\) | \(12\) |
Determinar si existe deficiencia de heterocigotos a algún nivel que nos permita sospechar apareamientos no-aleatorios dentro de las mismas o alguna estructuración geográfica.
Ejercicio 6.2
En una misma región han evolucionado en aislamiento dos poblaciones del mismo tamaño, durante suficiente tiempo como para que las frecuencias de un alelo, en un locus diploide con dos alelos, sea \(p_1=0,65\) en la primera y \(p_2=0,25\) en la segunda. Ambas poblaciones se encuentran en equilibrio Hardy-Weinberg.
- Calcular las frecuencias de heterocigotos en ambas poblaciones,
- Calcular el promedio de las frecuencias de heterocigotos,
- Calcular el incremento en la frecuencia a causa del efecto Wahlund cuando las mismas dos poblaciones se combinan y reproducen en panmixia.
Ejercicio 6.3
En una región se estimaron las frecuencias de un alelo, en un locus con dos alelos (especie diploide), en 10 poblaciones diferentes (\(p_1=0,35\);\(p_2=0,40\); \(p_3=0,25\); \(p_4=0,30\); \(p_5=0,35\); \(p_6=0,40\); \(p_7=0,60\); \(p_8=0,65\); \(p_9=0,70\); \(p_{10}=0,75\)).
A fin de determinar el nivel de diferenciación genética en la región, calcular el estimador \(F_{ST}\) a partir de estas frecuencias.
Ejercicio 6.4
- Calcular los valores de equilibrio de \(F_{ST}\) para \(Nm=0,25\), \(Nm=4\) y \(Nm=10\) individuos migrantes por generación, y
- Determinar si se trata de poblaciones diferenciadas significativamente en cada caso (utilizando los criterios en las guías prácticas de Wright).
- Encontrar el número mínimo de migrantes por generación que producen una diferenciación menor a \(F_{ST}=0,05\).
Ejercicio 6.5
En una población de cabras de la raza Golden Guernsey (una raza producto de la cruza de razas locales de la isla de Guernsey con Anglo Nubian y razas suizas, hoy en peligro de extinción) se determinó que el valor del coeficiente de endocría es \(F=0,15\).
- Calcular las frecuencias genotípicas esperadas para un locus diploide con dos alelos en el cuál la frecuencia del alelo \(A_1\) es \(p=0,6\).
- ¿Faltan o sobran heterocigotos respecto al equilibrio de Hardy-Weinberg bajo panmixia?
Ejercicio 6.6
En un estudio sobre diversidad en 3 poblaciones de Tucu-tucus (Ctenomys pearsoni), partir de la secuenciación de una región específica del genoma, se encontró que para un locus determinado, que se encuentra representado por un SNP en particular, las 3 poblaciones eran polimórficas. En el análisis de 50 individuos de cada población (diploides) se encontraron las siguiente frecuencias alélicas para el alelo A (el otro es el G), \(p_1=0,25\), \(p_2=0,62\) y \(p_3=0,74\), mientras que el número de heterocigotos observado en cada una fue de \(12\), \(14\) y \(11\), respectivamente.
- Calcular los 3 estadísticos \(F\),
- Determinar si existe diferenciación genética entre las 3 poblaciones, y si hay señales de endocría dentro de las 3 poblaciones.
Ejercicio 6.7
Un conjunto de poblaciones de una especie de pez de agua dulce habita en 6 espejos de agua que se encuentran en la periferia de una planicie central. Ocasionalmente, en momentos de muy alta pluviosidad puntual (que suele ocurrir todos los años) los 6 espejos pueden quedar conectados por un breve plazo (hasta que baja el agua nuevamente). En un estudio genético sobre las 6 poblaciones, en un locus (en principio neutral) con dos alelos, se llegó a que la frecuencia media (entre todas las poblaciones) del alelo G era de \(\bar{p}=0,37\), mientras que la varianza de frecuencias para ese alelo entre las 6 poblaciones era de \(\sigma_p^2=0,019\).
Suponiendo que las 6 poblaciones son aproximadamente del mismo tamaño y que el posible intercambio entre cualquier de ellas es igual de posible, determinar el número de migrantes por generación desde cada población.